Химические реактивы: онлайновые каталоги

4. Химические реактивы: онлайновые каталоги

Самостоятельная работа.

Ознакомьтесь с сайтами, перечисленными ниже.
Найдите поисковые бланки или ссылки, ведущие к поисковым бланкам.
Изучите возможности простейших и усложненных поисковых бланков.
Самостоятельно проведите поиск сведений о реактиве (например, фенол - phenol, бензол - benzene и т.д.).
Изучите структуру и объем материала, получаемого в результате поиска.

Каталоги крупных компаний

Merck/Sigma-Aldrich.

Простейший поисковый бланк - вверху страницы, ссылки на усложненный бланк и на бланк структурного поиска - при щелчке по полю простейшего бланка.

Контрольное задание 1: поиск по названию вещества.

Предположим, для проведения некоего органического синтеза потребуется 1 л анилина (aniline).
Какая сумма денег необходима для покупки реактива?

Подсказки:
1. Поиск с простейшего бланка даст излишнее количество нерелевантных результатов. Воспользуйтесь усложненным бланком.
2. Для решения этой задачи на поисковом бланке есть раздел Data Specific Search. Поле поиска -- "Название товара" (Product Name).
3. Фирма продает реактивы разной степени чистоты, и цены на них могут отличаться разительно. Проявите разумный подход при выборе качества реактива, требующегося в данной задаче.

Структурный поиск

Во многих базах данных, содержащих сведения о химических структурах, имеется возможность вести информационный поиск, используя в качестве запроса двумерную структурную формулу.
В таких базах данных можно встретить три варианта действий поисковой программы; обычно пользователь сам выбирает нужный ему вариант из имеющегося набора.

1. Поиск по структуре - Structure (Exact) Search.
Поисковая программа ищет структуры, полностью совпадающие со структурой запроса.

2. Поиск по подструктуре (субструктуре) - Подструктурный (субструктурный) поиск - Substructure Search.
Поисковая программа ищет структуры, в остовах которых есть участок, целиком совпадающий с остовом запроса.

3. Поиск по подобию - Similarity Search.
Поисковая программа ищет структуры, в которых имеются такие же структурные фрагменты, какие есть в запросе.
На поисковом бланке обычно можно задать минимально допустимую степень соответствия, в %.

Апплет

Апплет — это маленькая исполняемая программа, которая загружается вместе с веб-страницей.

С помощью таких апплетов конструируют запросы в тех базах данных, где возможен поиск по структурной формуле.

Приемы работы с апплетом весьма схожи с приемами работы с "большим" молекулярным редактором, таким как ISIS/Draw — только намного проще.
Основная задача апплета — правильно отобразить молекулярный граф, на основании которого должен проводиться поиск. Красота формируемого изображения не имеет никакого значения в поисковом процессе, поэтому у таких апплетов нередко отсутствуют дизайнерские функции (выравнивание длин связей, валентных углов, поворот в плоскости листа и т. п.).
Инструментарий апплета как правило ограничивается управляющими командами (стереть, выделить) и кнопками химических символов (главным образом "органического" набора), химических связей (главным образом не отражающих симметрию), простейших структурных фрагментов (например, циклов).

Стандартизация в работе различных апплетов отсутствует, но приемы работы просты настолько, что при минимуме навыков они оказываются интуитивно понятными.

Контрольное задание 2: поиск по структуре.

Выведите на экран бланк Structure Search.

Прочитайте основные правила работы с апплетом Marvin JS:
Краткая инструкция по работе с Marvin JS.
Решите контрольную задачу:
Контрольное задание 2.

Ознакомьтесь с еще одним каталогом и с метасайтами:

Alfa Aesar.
Простейший поисковый бланк - вверху, ссылки на усложненный бланк и на бланк структурного поиска - под логотипом в меню "Products".

Метасайты

ChemExper.
Поисковый бланк, в том числе для структурного поиска.
В результатах поиска перечислены продавцы, адреса их сайтов, но прямые ссылки на соответствующую страницу каталога не приводятся.

BuyersGuideChem.
Широкий географический охват компаний. Сайт зарегистрирован в Германии, поэтому неплохая информация для европейского покупателя.
В результатах поиска перечислены продавцы, адреса их сайтов, но прямые ссылки на соответствующую страницу каталога не приводятся.

Chemical Book.
В результатах поиска большой список поставщиков химических товаров, причем можно вывести на экран компании нужной страны.