ABC Chemistry : Home > Практикум. Часть 2 : Оглавление


А. А. Рагойша

Поиск информации о структуре химического вещества
в онлайновых базах данных.
Руководство к практикуму - часть 2


 

 
 
Избранные ссылки
 1. Кристаллографическая информация в WWW ICSD, COD
Acta Crystallographica Section E
Инсталлятор Mercury
 2. Структурный поиск NIST Chemistry WebBook
Sigma-Aldrich
SureChEMBL
 3. Линейные нотации. CAS RN, SMILES, InChI Common Chemistry
ChemSpider
PubChem Sketcher

 4. Где купить реактив: каталоги
 
Acros Organics, Alfa Aesar, Sigma-Aldrich
ChemExper, BuyersGuideChem

 5. Органический синтез: онлайновые ресурсы
 
ChemSynthesis, Organic Chemistry Portal
ChemSpider SyntheticPages
Organic Syntheses

 6. Спектральные базы данных (на примере ЯМР)
 
ChemSpider, Organic Chemistry Info
NMRShiftDB2, SDBS
 7. Спектральные базы данных:
      масс-спектрометрия, ИК-спектроскопия
NIST Chemistry WebBook
SDBS
Spectral Game

 8. Пакет программ ACD/ChemSketch Freeware
 
Инсталлятор ACD/ChemSketch Freeware
(проверка антивирусом при инсталляции обязательна)

Цель этого этапа работы — познакомиться с некоторыми важнейшими структурными базами данных, попытаться оценить их достоинства и недостатки, определить области целесообразного их использования в научной практике, изучить приемы ведения информационного поиска и анализа извлекаемых результатов.

Основная часть структурной информации находится в области "скрытого" Интернета, поэтому для обнаружения необходимых сведений следует применять не универсальные поисковые системы, а специализированные поисковые программы. Как правило, каждая база данных имеет свой поисковый инструмент, который, кроме общепринятых элементов, может содержать в себе весьма специфические детали. В каждой главе пособия приводятся методические руководства по работе с соответствующими типами программ; в тех случаях, когда такая инструкция отсутствует, студент обязан самостоятельно разобраться с алгоритмом функционирования программы, основываясь на своем предыдущем опыте.

В ходе практикума обсуждаются простейшие задачи, с которыми особенно часто встречается химик в своей повседневной работе — поиск информации о структуре и свойствах вещества, идентификация индивидуального вещества по спектральным данным, письменное оформление химически значимого текста. Предполагается, что навыки освоения таких операций должны быть доведены до автоматизма, требующегося при решении комплекных проблем на старших курсах обучения.

Главы, посвященные спектральным базам данных, содержат краткие описания соответствующих методов исследования.
Терминология хемоинформатики рассмотрена в лекционном курсе.


PDF 2,19 MB А.А. Рагойша. Поиск информации о структуре химического вещества в онлайновых базах данных : практикум по курсу “Информационные технологии в химии” для студентов специальности 1-31 05 01 Химия (по направлениям) / Минск : БГУ, 2013. – 101 с.

А. А. Рагойша. Поиск информации о структуре химического вещества в онлайновых базах данных. БГУ. 1999-2017.
URL: http://www.abc.chemistry.bsu.by/structure/