|
|
ABC Chemistry / ИТ в химии : Практикум. Ч. 2. : Оглавление / 8. Пакет программ ACD/ChemSketch Freeware |
Минилекция: Двумерная форма хранения структурной информации. MOL-файлы
Пакет ACD/ChemSketch Freeware состоит из двух автономных, но взаимосвязанных программ:
В компьютерных классах химфака установлен пакет ACD/ChemSketch Freeware v.12.0.
В основной своей части принципы работы с ACD/ChemSketch Freeware аналогичны принципам работы с теми редакторами, которые вам уже знакомы, поэтому вы должны самостоятельно разобраться с основными функциями программ этого пакета. Некоторые особенности поясняются в прилагаемых инструкциях.
а) ACD/ChemSketch как молекулярный редактор двумерных химических структур.
Самостоятельная работа.
Изучите приемы работы с молекулярным редактором (режим Structure), выполните упражнения и контрольные задания.
Краткое описание основных функций программы ACD/ChemSketch (режим Structure).
б) ACD/ChemSketch как графический редактор.
Самостоятельная работа.
Изучите приемы работы с графическим редактором (режим Draw), выполните упражнения и контрольные задания.
Краткое описание основных функций программы ACD/ChemSketch (режим Draw).
в) ACD/3D Viewer.
Самостоятельная работа.
Изучите приемы работы с программой ACD/3D Viewer, выполните упражнения и контрольные задания.
Краткое описание основных функций программы ACD/3D Viewer и контрольные задания.
Файлы в формате MOL
Формат MOL де-факто является стандартным форматом обмена структурной информацией. Краткое описание MOL-формата имеется в лекции.
Самостоятельная работа 1.
В ChemSketch изобразите двумерную графическую формулу уксусной кислоты.
Сохраните структуру в MOL-формате (MDL molfile v. 2.0).
Откройте сохраненный файл в текстовом редакторе.
Будьте готовы объяснить преподавателю смысл чисел, хранящихся в файле.
Самостоятельная работа 2.
Проведите 3D-оптимизацию изображенной ранее графической формулы уксусной кислоты.
Сохраните трехмерную структуру в MOL-формате (MDL molfile v. 2.0).
Откройте сохраненный файл в текстовом редакторе.
Будьте готовы объяснить преподавателю смысл чисел, хранящихся в файле.
Справка
Полезные ссылки:
Сайт разработчика ACD/Labs
Инсталлятор ACD/ChemSketch Freeware (проверка антивирусом при инсталляции обязательна)
Белорусский государственный университет 2010-2019 |
|